Intorno al 1450 Francesco II Del Balzo, III duca d’Andria, IV Conte di Montescaglioso e Signore di Pomarico, accettò paternamente le preghiere dei pomaricani che imploravano la costruzione di una chiesa nuova e più ampia rispetto a Santa Margherita e fece costruire la prima Chiesa Madre, dedicata a San Michele Arcangelo. La chiesa era formata da una sola navata, sostenuta da un grande arco centrale, con due porte sul prospetto a settentrione: una piccola ed una grande, denominata “Venna”, ed un’altra porta sul lato orientale detta “Porta delle donne”. Presenta una facciata barocca con un imponente campanile, ed il suo interno è a croce latina. Sono conservate tele di Pietro Antonio Ferro datate 1601 e Andrea Vaccaro, una statua lignea di San Michele risalente al 1400 e un pregevole antifonario del XVI secolo.